Neptün atmosferinde ölçülen rüzgâr hızları saatte 2.000 kilometreyi aşabilir. Gezegen Güneş'ten çok az enerji almasına rağmen atmosferinde son derece güçlü hava akımları oluşur. Dünya'daki fırtınalar bunun yanında hafif esinti gibi kalır.